تقع في الطابق الثاني من جامع تريم تأسست سنة 1972هـ من مجموعة من مكتبات أهلية ومن متادر متعددة من لكل من آل الكاف وآل بن يحيى وآل بن سهل والحداد ورباط تريم وآل الحسيني وآل العيدروس من الحزم ومكتبة السلطان صالح القعيطي من المكلا ومن مصادر أخرى.
وتحتوي على 6200مخطوطة مرتبة في الدواليب على حسب الفنون كما تحتوي على 270 مطبوع وتفتح أبوابها من الصباح وحتى إلى ما بعد الظهر
مكتبة الأحقاف للمطبوعات:
تقع في الجانب الجنوبي من قصر الرناد وتحتوي على عدد كبير من المطبوعات القديمة والحديثة وتفتح أبوابها من الصباح إلى الظهر

وتقع في الطابق الثاني من مسجد خرد بالخليف وتحتوي على عدد كبير من المطبوعات والمخطوطات وتفتح أبوابها بعد صلاة العصر إلى المساء.

تأسست سنة 1331هـ وأعيد بناؤها من جديد سنة 143هـ وتقع بجانب مسجد بروم وتحتوي على عدد من الكتب المطبوعة في فنون متعددة وتفتح أبوابها الصباح إلى الظهر ومن العصر إلى المغرب.

ويقع في حارة الروضة بعيديد ويحتوي على عدد كبير من المخطوطات النفيسة والنادرة وكذلك المطبوعات القديمة والحديثة وبالمركز معلم لتصميم المخطوطات بآلية حديثة وكذلك قسم التوثيق وأشياء أخرى ويفتح أبوابه من الصباح إلى ما بعد الظهر.

تقع في حارة الخليف تأسست سنة 2016م وتحتوي على عدد من الكتب المطبوعة و المخطوطة وتفتح أبوابها الصباح والعصر والمساء.

هو مركز متخصص في طباعة ونشر المؤلفات الحضرمية الصادرة عن علماء حضرموت في مجالات العلمية والأدبية والثقافية والتاريخية أنشأه السيد عبدالرحمن بن علي بلفقيه عام 2000م ، وله مكتبة مختصة ببيع الكتب الحضرمية تسمى “المكتبة الحضرمية”.

وتقع بحوطة آل أبي علوي بجانب مسجد العيدروس وأسست في القرن الرابع عشر الهجري وهي بحمد الله فاتحة أبوابها لطلاب العلم وتقام بها دروس متنوعة وفي أوقات مختلفة.